1、生产制造洞洞鞋的材料，特别是一些杂牌低价的洞洞鞋，普遍是含有苯二躅糌编嫜甲酸酯这种物质，除了存在刺激的味道，也是一种具有致癌风险的物质，这个危害是要引起注意的,，尽可能不要购买低价的洞洞鞋。
2、洞洞鞋虽然有很多洞可以帮助通风，但是由于其材质和设计，鞋孔只能是少部分透气，所以长期穿着并不利于脚部的干燥，对脚部的皮肤不好。
3、由于洞洞鞋的构造，很多卫生死角，加上清洁不会经常并且彻底，而且基本都是光脚穿，很容易滋生真菌感染脚气。
4、洞洞鞋的材质也比较软，相对容易变形，所以很容易被碰到造成伤害，比如说商场扶梯如果不慎容易将将脚卷入电梯，特别是小孩子更是高危人群。
5、洞洞鞋的材质相对表面比较光滑，出汗或者进入水后容易存水形成光滑的水膜，这样就不防滑，容易出现摔倒。
6、洞洞鞋宽大的鞋面和独特的构造，会对人走路的步态有影响，特别是对于生长发育期的小孩子，长期穿着会影响发育，因此不宜长期穿。
