TRAF基因和TAK基因的克隆方法

 时间:2024-10-14 07:20:42

1、首先,在根据GenBank中已提交的鱼类TRAF6和TAKIcDNA序列的保守区设计兼并引物(TRAF6-F/TRAF6R;TAKI-F/TAK1-R)。

TRAF基因和TAK基因的克隆方法

2、然后,扩增TRAF6和TAKI基因的核心片段。PCR产物经1%琼脂糖凝胶电泳检测后,与PMD18-T(TaKaRa,Japan)载体连接,转人trans5a感受态细胞中,筛选阳性克隆进行测序。

TRAF基因和TAK基因的克隆方法

3、然后,通过BLAST比对分析后获得TRAF6和TAKI基因的核心片段,根据得到的核心片段设计RACE特异性引物(表1),利用巢式PCR扩增TRAF6和TAKI基因的5'和3'末端。

TRAF基因和TAK基因的克隆方法

4、然后,在电泳检测目的片段后,连接到载体,转化trans5a感受态细胞,筛选阳性姨捃孜粹克隆送测序。BLAST分析测序结果,Seqman软件拼接得到的序列,最终获得半滑舌鳎TRAF6和TAKI基因全序列。

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5、然后,进行序列比对和系统进化分析,利用EditSeq软件预测TRAF6和TAKI基因的开放阅读框(ORF)及可能编码的氨基酸序列。

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6、最后,预测和分析蛋白结构城,在NCBI数据库中搜寻其他物种的TRAF6和TAKI的氨基酸序列,利用MEGAS.O软件,以Neighborjining法构建系统进化树。

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