有闪电鸟、急冻鸟、火焰鸟、露奇亚、凤凰、代欧奇西斯、梦幻、超梦。梦幻在红莲道观旁边的遗皴蹭珩靡迹里面。超梦在超梦洞穴。
闪电鸟在无人电锁。冰鸟在双子岛。火焰鸟是在1岛的火山顶上。吉拉奇在幽灵塔最顶层。凤凰和露奇亚在8岛。代欧奇西斯在双子岛钓到。
神兽是《口袋妖怪》系列游戏中非常罕见的珍贵宝可梦。有的贯穿游戏的剧情，有的沉睡在迷宫的深处，每种传说宝可梦在游戏中只存在一只。
在战胜四天王并进入冠军房间后，玩家发现N已击败了阿戴克成为了新任冠军。他随即召唤自己的城堡包围了联盟，并向玩家发起挑战。
当玩家接近N时，莱希拉姆（黑）或捷克罗姆（白）在玩家面前出现，玩家需要收服传说中的龙宝可梦来与N对战。在战败后，N对于自己的错误理想感到悲哀。
而魁奇思现身，揭露了自己的真实意图：借助N来保证自己是世界上唯一一个能够控制宝可梦的人，并借助宝可梦征服世界。暴怒的魁奇思挑战了玩家。
